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      科研動態

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      農民日報:中國熱科院發布白木香基因組精細圖譜

      發布時間:2020-06-10     瀏覽次數:

             近日,由中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所國家中藥材產業技術體系??诰C合試驗站和中國農業科學院深圳農業基因組研究所崔鵬團隊合作發布了白木香基因組精細圖譜,相關研究結果已發表。


        基因組精細圖譜的發布將為野生白木香種群保護生物學、沉香結香機制和香味基因及樹種的進化研究奠定良好基礎,也為進一步基于基因組的白木香分子育種工作提供了可能,在基礎研究及應用領域均具有重要意義。


        這項研究利用OxfordNanopore和Il?lumina測序,結合Hi-C數據生成了220.61Gb的高質量讀長。組裝后的白木香基因組大小約為726.5Mb,其中716.6Mb的序列被錨定至8條染色體上,ScaffoldN50為88.78Mb,BUSCO分析結果為95.2%。重復序列占基因組的比例為59.13%,共注釋了29203個蛋白質編碼基因。根據單拷貝基因的系統發育和分化時間估算,發現白木香與其在錦葵目的最近共同祖先大約在53.18-84.37百萬年前分開。


        據介紹,白木香是瑞香科中第一個基因組組裝至染色體水平的物種,隨著后期更多個性化數據的裝配和分析,新版基因組圖譜將持續保持更新。


        白木香是傳統名貴藥材和天然香料“沉香”的重要基源植物,主要分布于中國南部的熱帶及亞熱帶地區。在自然條件下,僅有7%-10%的白木香可以結香,且形成過程極為緩慢,通常需要數十年。良好的醫藥價值和巨大的經濟效益,導致了對白木香的掠奪式采伐,其野生資源已日漸枯竭。野生白木香是國家II級保護植物、被《中國生物多樣性紅色名錄(高等植物卷)》和IUCNRedlist列為易危物種,收錄在CITES附錄二中。


        海南省政府對沉香產業高度重視,為全面推動海南沉香產業發展,近年來相繼印發《海南省沉香產業發展規劃(2018-2025年)》和《海南省推進沉香產業創新發展工作方案》,就規范沉香科學種植、提升科技創新能力、推動產業高質量發展、完善市場建設等方面提出明確任務,提出要逐步把海南省建設成為世界優質沉香原料基地、全國最大的精深加工生產基地和貿易中心。


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